No caso das piscinas que utilizam cloro, este tem a desvantagem de secar a pele, as mucosas e os olhos. Pessoas que passam um número elevado de horas semanais nestas piscinas, como os praticantes de natação, sofrem também descoloração dos dentes e desenvolvimento de manchas acastanhadas, que resultam da combinação dos produtos químicos usados no tratamento da água, com a sua própria saliva.
A desinfecção eficaz de uma piscina convencional exige, para além da utilização de cloro, outros produtos químicos, nomeadamente algicidas, fungicidas e floculantes, para além de produtos destinados ao ajuste do pH. Como alguns destes produtos não podem ser aplicados simultaneamente, o proprietário de uma piscina deste tipo acaba por ter que seguir um calendário de aplicação dos diferentes produtos, que se pode tornar bastante exigente e aborrecido.