A água fica sempre transparente e respeita todas as normas exigidas por lei para a qualidade da água balnear.

A qualidade da água da piscina biológica depende muito da qualidade da água do primeiro enchimento. Não podemos usar todas as águas, p.e. as contaminadas por microorganismos cujos teores já ultrapassam as normas para a água balnear. Também a composição química tem de ficar abaixo de certos valores, em especial os dos nutrientes para plantas. Eventualmente tem que se prever pré-tratamentos para tornar a água apta para ser usada na piscina biológica.

Por isso, uma análise da água é obrigatória antes de iniciar o planeamento da piscina biológica.